X-Ray Science Performed At MFX
T. Fransson, R. Alonso-Mori, R. Chatterjee, M. H. Cheah, M. Ibrahim, R. Hussein, M. Zhang, F. Fuller, S. Gul, I.-S. Kim, P. S. Simon, I. Bogacz, H. Makita, C. de Lichtenberg, S. Song, A. Batyuk, D. Sokaras, R. Massad, M. Doyle, A. Britz, C. Weninger, A. Zouni, J. Messinger, V. K. Yachandra, J. Yano, J. Kern and U. Bergmann, "
Effects of x-ray free-electron laser pulse intensity on the Mn Kβ1,3 x-ray emission spectrum in photosystem II—A case study for metalloprotein crystals and solutions",
Struct. Dyn. 8, 064302 (2021) doi: 10.1063/4.0000130
R. Hussein, M. Ibrahim, A. Bhowmick, P. S. Simon, R. Chatterjee, L. Lassalle, M. Doyle, I. Bogacz, I.-S. Kim, M. H. Cheah, S. Gul, C. de Lichtenberg, P. Chernev, C. C. Pham, I. D. Young, S. Carbajo, F. D. Fuller, R. Alonso-Mori, A. Batyuk, K. D. Sutherlin, A. S. Brewster, R. Bolotovsky, D. Mendez, J. M. Holton, N. W. Moriarty, P. D. Adams, U. Bergmann, N. K. Sauter, H. Dobbek, J. Messinger, A. Zouni, J. Kern, V. K. Yachandra and J. Yano, "
Structural dynamics in the water and proton channels of photosystem II during the S2 to S3 transition",
Nat. Commun. 12, 6531 (2021) doi: 10.1038/s41467-021-26781-z
S. M. Keable, A. Kölsch, P. S. Simon, M. Dasgupta, R. Chatterjee, S. K. Subramanian, R. Hussein, M. Ibrahim, I.-S. Kim, I. Bogacz, H. Makita, C. C. Pham, F. D. Fuller, S. Gul, D. Paley, L. Lassalle, K. D. Sutherlin, A. Bhowmick, N. W. Moriarty, I. D. Young, J. P. Blaschke, C. de Lichtenberg, P. Chernev, M. H. Cheah, S. Park, G. Park, J. Kim, S. J. Lee, J. Park, K. Tono, S. Owada, M. S. Hunter, A. Batyuk, R. Oggenfuss, M. Sander, S. Zerdane, D. Ozerov, K. Nass, H. Lemke, R. Mankowsky, A. S. Brewster, J. Messinger, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, J. Yano, A. Zouni and J. Kern, "
Room temperature XFEL crystallography reveals asymmetry in the vicinity of the two phylloquinones in photosystem I",
Sci. Rep. 11, 21787 (2021) doi: 10.1038/s41598-021-00236-3
P. Rabe, J. J. A. G. Kamps, K. D. Sutherlin, J. D. S. Linyard, P. Aller, C. C. Pham, H. Makita, I. Clifton, M. A. McDonough, T. M. Leissing, D. Shutin, P. A. Lang, A. Butryn, J. Brem, S. Gul, F. D. Fuller, I.-S. Kim, M. H. Cheah, T. Fransson, A. Bhowmick, I. D. Young, L. O'Riordan, A. S. Brewster, I. Pettinati, M. D. Doyle, Y. J. Joti, S. O. Owada, K. Tono, A. Batyuk, M. S. Hunter, R. Alonso-Mori, U. Bergmann, R. L. Owen, N. K. Sauter, T. D. W. Claridge, C. V. Robinson, V. K. Yachandra, J. Yano, J. F. Kern, A. M. Orville and C. J. Schofield, "
X-ray free-electron laser studies reveal correlated motion during isopenicillin N synthase catalysis",
Sci. Adv. 7, eabh0250 (2021) doi: 10.1126/sciadv.abh0250
S. Durdagi, C. Dag, B. Dogan, M. Yigin, T. Avsar, C. Buyukdag, I. Erol, F. B. Ertem, S. Calis, G. Yildirim, M. D. Orhan, O. Guven, B. Aksoydan, E. Destan, K. Sahin, S. O. Besler, L. Oktay, A. Shafiei, I. Tolu, E. Ayan, B. Yuksel, A. B. Peksen, O. Gocenler, A. D. Yucel, O. Can, S. Ozabrahamyan, A. Olkan, E. Erdemoglu, F. Aksit, G. Tanisali, O. M. Yefanov, A. Barty, A. Tolstikova, G. K. Ketawala, S. Botha, E. H. Dao, B. Hayes, M. Liang, M. H. Seaberg, M. S. Hunter, A. Batyuk, V. Mariani, Z. Su, F. Poitevin, C. H. Yoon, C. Kupitz, R. G. Sierra, E. H. Snell and H. DeMirci, "
Near-physiological-temperature serial crystallography reveals conformations of SARS-CoV-2 main protease active site for improved drug repurposing",
Structure 29, 1 (2021) doi: 10.1016/j.str.2021.07.007
M.-Y. Lee, J. Geiger, A. Ishchenko, G. W. Han, A. Barty, T. A. White, C. Gati, A. Batyuk, M. S. Hunter, A. Aquila, S. Boutet, U. Weierstall, V. Cherezov and W. Liu, "
Harnessing the power of an X-ray laser for serial crystallography of membrane proteins crystallized in lipidic cubic phase",
IUCrJ 7, 976 (2020) doi: 10.1107/S2052252520012701
M. L. Shelby, D. Gilbile, T. D. Grant, W. J. Bauer, B. Segelke, W. He, A. C. Evans, N. Crespo, P. Fischer, T. Pakendorf, V. Hennicke, M. S. Hunter, A. Batyuk, M. Barthelmess, A. Meents, T. L. Kuhl, M. Frank and M. A. Coleman, "
Crystallization of ApoA1 and ApoE4 Nanolipoprotein Particles and Initial XFEL-Based Structural Studies",
Crystals 10, 886 (2020) doi: 10.3390/cryst10100886
V. Srinivas, R. Banerjee, H. Lebrette, J. C. Jones, O. Aurelius, I.-S. Kim, C. C. Pham, S. Gul, K. Sutherlin, A. Bhowmick, J. John, E. Bozkurt, T. Fransson, P. Aller, A. Butryn, I. Bogacz, P. S. Simon, S. Keable, A. Britz, K. Tono, K.-S. Kim, S.-Y. Park, S.-J. Lee, J. Park, R. Alonso-Mori, F. Fuller, A. Batyuk, A. Brewster, U. Bergmann, N. Sauter, A. M. Orville, V. K. Yachandra, J. Yano, J. D. Lipscomb, J. F. Kern and M. Högbom, "
High Resolution XFEL Structure of the Soluble Methane Monooxygenase Hydroxylase Complex with its Regulatory Component at Ambient Temperature in Two Oxidation States",
J. Am. Chem. Soc. (2020) doi: 10.1021/jacs.0c05613
M. Ibrahim, T. Fransson, R. Chatterjee, M. H. Cheah, R. Hussein, L. Lassalle, K. D. Sutherlin, I. D. Young, F. D. Fuller, S. Gul, I.-S. Kim, P. S. Simon, C. de Lichtenberg, P. Chernev, I. Bogacz, C. C. Pham, A. M. Orville, N. Saichek, T. Northen, A. Batyuk, S. Carbajo, R. Alonso-Mori, K. Tono, S. Owada, A. Bhowmick, R. Bolotovsky, D. Mendez, N. W. Moriarty, J. M. Holton, H. Dobbek, A. S. Brewster, P. D. Adams, N. K. Sauter, U. Bergmann, A. Zouni, J. Messinger, J. Kern, V. K. Yachandra and J. Yano, "
Untangling the sequence of events during the S2 → S3 transition in photosystem II and implications for the water oxidation mechanism",
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 117, 12624 (2020) doi: 10.1073/pnas.2000529117
K. R. Miller, J. D. Paretsky, A. H. Follmer, T. Heinisch, K. Mittra, S. Gul, I.-S. Kim, F. D. Fuller, A. Batyuk, K. D. Sutherlin, A. S. Brewster, A. Bhowmick, N. K. Sauter, J. Kern, J. Yano, M. T. Green, T. R. Ward and A. S. Borovik, "
Artificial Iron Proteins: Modeling the Active Sites in Non-Heme Dioxygenases",
Inorg. Chem. (2020) doi: 10.1021/acs.inorgchem.9b03791
A. M. Wolff, I. D. Young, R. G. Sierra, A. S. Brewster, M. W. Martynowycz, E. Nango, M. Sugahara, T. Nakane, K. Ito, A. Aquila, A. Bhowmick, J. T. Biel, S. Carbajo, A. E. Cohen, S. Cortez, A. Gonzalez, T. Hino, D. Im, J. D. Koralek, M. Kubo, T. S. Lazarou, T. Nomura, S. Owada, A. J. Samelson, T. Tanaka, R. Tanaka, E. M. Thompson, H. van den Bedem, R. A. Woldeyes, F. Yumoto, W. Zhao, K. Tono, S. Boutet, S. Iwata, T. Gonen, N. K. Sauter, J. S. Fraser and M. C. Thompson, "
Comparing serial X-ray crystallography and microcrystal electron diffraction (MicroED) as methods for routine structure determination from small macromolecular crystals",
IUCrJ 7, 306 (2020) doi: 10.1107/S205225252000072X
J. Knoska, L. Adriano, S. Awel, K. R. Beyerlein, O. Yefanov, D. Oberthuer, G. E. P. Murillo, N. Roth, I. Sarrou, P. Villanueva-Perez, M. O. Wiedorn, F. Wilde, S. Bajt, H. N. Chapman and M. Heymann, "
Ultracompact 3D microfluidics for time-resolved structural biology",
Nat. Commun. 11, 657 (2020) doi: 10.1038/s41467-020-14434-6
E. S. Burgie, J. A. Clinger, M. D. Miller, A. S. Brewster, P. Aller, A. Butryn, F. D. Fuller, S. Gul, I. D. Young, C. C. Pham, I.-S. Kim, A. Bhowmick, L. J. O'Riordan, K. D. Sutherlin, J. V. Heinemann, A. Batyuk, R. Alonso-Mori, M. S. Hunter, J. E. Koglin, J. Yano, V. K. Yachandra, N. K. Sauter, A. E. Cohen, J. Kern, A. M. Orville, G. N. Phillips, Jr. and R. D. Vierstra, "
Photoreversible Interconversion of a Phytochrome Photosensory Module in the Crystalline State",
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 117, 300 (2020) doi: 10.1073/pnas.1912041116
J. H. Artz, O. A. Zadvornyy, D. W. Mulder, S. M. Keable, A. E. Cohen, M. W. Ratzloff, S. G. Williams, B. Ginovska, N. Kumar, J. Song, S. E. McPhillips, C. Davidson, A. Y. Lyubimov, N. Pence, G. J. Schut, A. K. Jones, S. M. Soltis, M. Adams, S. Raugei, P. W. King and J. W. Peters, "
Tuning catalytic bias of hydrogen gas producing hydrogenases",
J. Am. Chem. Soc. 142, 1227 (2020) doi: 10.1021/jacs.9b08756
M. L. Shelby, D. Gilbile, T. D. Grant, C. Seuring, B. W. Segelke, W. He, A. C. Evans, T. Pakendorf, P. Fischer, M. S. Hunter, A. Batyuk, M. Barthelmess, A. Meents, M. A. Coleman, T. L. Kuhl and M. Frank, "
A fixed-target platform for serial femtosecond crystallography in a hydrated environment",
IUCrJ 7, (2019) doi: 10.1107/S2052252519014003
M. Dasgupta, D. Budday, S. H. P. d. Oliveira, P. Madzelan, D. Marchany-Rivera, J. Seravalli, B. Hayes, R. G. Sierra, S. Boutet, M. S. Hunter, R. Alonso-Mori, A. Batyuk, J. Wierman, A. Lyubimov, A. S. Brewster, N. K. Sauter, G. A. Applegate, V. K. Tiwari, D. B. Berkowitz, M. C. Thompson, A. E. Cohen, J. S. Fraser, M. E. Wall, H. van den Bedem and M. A. Wilson, "
Mix-and-inject XFEL crystallography reveals gated conformational dynamics during enzyme catalysis",
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 116, 25634 (2019) doi: 10.1073/pnas.1901864116
A. Echelmeier, D. Kim, J. C. Villarreal, J. Coe, S. Quintana, G. Brehm, A. Egatz-Gomez, R. Nazari, R. G. Sierra, J. E. Koglin, A. Batyuk, M. S. Hunter, S. Boutet, N. Zatsepin, R. A. Kirian, T. D. Grant, P. Fromme and A. Ros, "
3D printed droplet generation devices for serial femtosecond crystallography enabled by surface coating",
J. Appl. Crystallogr. 52, (2019) doi: 10.1107/S1600576719010343
R. G. Sierra, A. Batyuk, Z. Sun, A. Aquila, M. S. Hunter, T. J. Lane, M. Liang, C. H. Yoon, R. Alonso-Mori, R. Armenta, J.-C. Castagna, M. Hollenbeck, T. O. Osier, M. Hayes, J. Aldrich, R. Curtis, J. E. Koglin, T. Rendahl, E. Rodriguez, S. Carbajo, S. Guillet, R. Paul, P. Hart, K. Nakahara, G. Carini, H. DeMirci, E. H. Dao, B. M. Hayes, Y. P. Rao, M. Chollet, Y. Feng, F. D. Fuller, C. Kupitz, T. Sato, M. H. Seaberg, S. Song, T. B. van Driel, H. Yavas, D. Zhu, A. E. Cohen, S. Wakatsukid and S. Boutet, "
The Macromolecular Femtosecond Crystallography Instrument at the Linac Coherent Light Source",
J. Synchrotron Radiat. 26, 346 (2019) doi: 10.1107/S1600577519001577
I. Ishigami, A. Lewis-Ballester, A. Echelmeier, G. Brehm, N. A. Zatsepin, T. D. Grant, J. D. Coe, S. Lisova, G. Nelson, S. Zhang, Z. F. Dobson, S. Boutet, R. G. Sierra, A. Batyuk, P. Fromme, R. Fromme, J. C. H. Spence, A. Ros, S.-R. Yeh and D. L. Rousseau, "
Snapshot of an oxygen intermediate in the catalytic reaction of cytochrome c oxidase",
Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2019) doi: 10.1073/pnas.1814526116
G. Blaj, A. Dragone, C. J. Kenney, F. Abu-Nimeh, P. Caragiulo, D. Doering, M. Kwiatkowski, B. Markovic, J. Pines, M. Weaver, S. Boutet, G. Carini, C.-E. Chang, P. Hart, J. Hasi, M. Hayes, R. Herbst, J. Koglin, K. Nakahara, J. Segal and G. Haller, "
Performance of ePix10K, a high dynamic range, gain auto-ranging pixel detector for FELs",
AIP Conf. Proc. 2054, 060062 (2019) doi: 10.1063/1.5084693
J. Kern, R. Chatterjee, I. D. Young, F. D. Fuller, L. Lassalle, M. Ibrahim, S. Gul, T. Fransson, A. S. Brewster, R. Alonso-Mori, R. Hussein, M. Zhang, L. Douthit, C. d. Lichtenberg, M. H. Cheah, D. Shevela, J. Wersig, I. Seuffert, D. Sokaras, E. Pastor, C. Weninger, T. Kroll, R. G. Sierra, P. Aller, A. Butryn, A. M. Orville, M. Liang, A. Batyuk, J. E. Koglin, S. Carbajo, S. Boutet, N. W. Moriarty, J. M. Holton, H. Dobbek, P. D. Adams, U. Bergmann, N. K. Sauter, A. Zouni, J. Messinger, J. Yano and V. K. Yachandra, "
Structures of the intermediates of Kok’s photosynthetic water oxidation clock",
Nature 563, 421 (2018) doi: 10.1038/s41586-018-0681-2
T. Fransson, R. Chatterjee, F. D. Fuller, S. Gul, C. Weninger, D. Sokaras, T. Kroll, R. Alonso-Mori, U. Bergmann, J. Kern, V. K. Yachandra and J. Yano, "
X-ray Emission Spectroscopy as an in Situ Diagnostic Tool for X-ray Crystallography of Metalloproteins Using an X-ray Free-Electron Laser",
Biochemistry 57, 4629 (2018) doi: 10.1021/acs.biochem.8b00325
C. O. Barnes, H. B. Gristick, N. T. Freund, A. Escolano, A. Y. Lyubimov, H. Hartweger, A. P. West, A. E. Cohen, M. C. Nussenzweig and P. J. Bjorkman, "
Structural characterization of a highly-potent V3-glycan broadly neutralizing antibody bound to natively-glycosylated HIV-1 envelope",
Nat. Commun. 9, 1251 (2018) doi: 10.1038/s41467-018-03632-y
M. C. Veale, P. Adkin, P. Booker, J. Coughlan, M. J. French, M. Hart, T. Nicholls, A. Schneider, P. Seller, I. Pape, K. Sawhney, G. A. Carini and P. A. Hart, "
Characterisation of the high dynamic range Large Pixel Detector (LPD) and its use at X-ray free electron laser sources",
J. Inst. 12, (2017) doi: 10.1088/1748-0221/12/12/P12003
F. D. Fuller, S. Gul, R. Chatterjee, E. S. Burgie, I. D. Young, H. Lebrette, V. Srinivas, A. S. Brewster, T. Michels-Clark, J. A. Clinger, B. Andi, M. Ibrahim, E. Pastor, C. de Lichtenberg, R. Hussein, C. J. Pollock, M. Zhang, C. A. Stan, T. Kroll, T. Fransson, C. Weninger, M. Kubin, P. Aller, L. Lassalle, P. Bruer, M. D. Miller, M. Amin, S. Koroidov, C. G. Roessler, M. Allaire, R. G. Sierra, P. T. Docker, J. M. Glownia, S. Nelson, J. E. Koglin, D. Zhu, M. Chollet, S. Song, H. Lemke, M. Liang, D. Sokaras, R. Alonso-Mori, A. Zouni, J. Messinger, U. Bergmann, A. K. Boal, J. M. Bollinger, Jr., C. Krebs, M. Hgbom, G. N. Phillips, Jr., R. D. Vierstra, N. K. Sauter, A. M. Orville, J. Kern, V. K. Yachandra and J. Yano, "
Drop-on-demand Sample Delivery for Studying Biocatalysts in Action at X-ray Free-electron Lasers",
Nat. Methods 14, 443 (2017) doi: 10.1038/nmeth.4195
I. D. Young, M. Ibrahim, R. Chatterjee, S. Gul, F. D. Fuller, S. Koroidov, A. S. Brewster, R. Tran, R. Alonso-Mori, T. Kroll, T. Michels-Clark, H. Laksmono, R. G. Sierra, C. A. Stan, R. Hussein, M. Zhang, L. Douthit, M. Kubin, C. de Lichtenberg, L. V. Pham, H. Nilsson, M. H. Cheah, D. Shevela, C. Saracini, M. A. Bean, I. Seuffert, D. Sokaras, T.-C. Weng, E. Pastor, C. Weninger, T. Fransson, L. Lassalle, P. Brauer, P. Aller, P. T. Docker, B. Andi, A. M. Orville, J. M. Glownia, S. Nelson, M. Sikorski, D. Zhu, M. S. Hunter, T. J. Lane, A. Aquila, J. E. Koglin, J. Robinson, M. Liang, S. Boutet, A. Y. Lyubimov, M. Uervirojnangkoorn, N. W. Moriarty, D. Liebschner, P. V. Afonine, D. G. Waterman, G. Evans, P. Wernet, H. Dobbek, W. I. Weis, A. T. Brunger, P. H. Zwart, P. D. Adams, A. Zouni, J. Messinger, U. Bergmann, N. K. Sauter, J. Kern, V. K. Yachandra and J. Yano, "
Structure of Photosystem II and Substrate Binding at Room Temperature",
Nature 540, 453 (2016) doi: 10.1038/nature20161
